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臨床(chuang)基因擴(kuo)(kuo)增(zeng)實驗(yan)(yan)又稱 PCR實驗(yan)(yan),是專門(men)用(yong)來(lai)檢(jian)(jian)(jian)驗(yan)(yan)艾滋(zi)病(bing)(bing)(bing)、乙型肝炎、禽疫病(bing)(bing)(bing)等病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)感染性(xing)(xing)疾病(bing)(bing)(bing)的(de)(de)一種檢(jian)(jian)(jian)測(ce)手段。它可以(yi)通過將病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)體(ti)內(nei)所含的(de)(de)基因進行(xing)(xing)擴(kuo)(kuo)增(zeng)的(de)(de)方(fang)法(fa),測(ce)出(chu)(chu)一些病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)含量不高的(de)(de)感染者(zhe)體(ti)內(nei)是否含有特定(ding)的(de)(de)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)。由于該檢(jian)(jian)(jian)測(ce)方(fang)法(fa)可以(yi)測(ce)出(chu)(chu)普通檢(jian)(jian)(jian)驗(yan)(yan)難以(yi)檢(jian)(jian)(jian)測(ce)出(chu)(chu)的(de)(de)病(bing)(bing)(bing)毒(du)(du)并具(ju)有靈敏度高、特異性(xing)(xing)高、快(kuai)捷、對(dui)樣(yang)品(pin)要(yao)求低等優點,因此被臨床(chuang)醫(yi)生廣為認可,已廣泛應用(yong)于醫(yi)院的(de)(de)臨床(chuang)診(zhen)斷和(he)各防疫檢(jian)(jian)(jian)測(ce)部門(men)的(de)(de)禽疫病(bing)(bing)(bing)診(zhen)斷。但是,這(zhe)種實驗(yan)(yan)需要(yao)有能保證安全、配(pei)置合理(li)的(de)(de)實驗(yan)(yan)室和(he)非常(chang)規范(fan)的(de)(de)操作(zuo)為前提。近年來(lai)對(dui)臨床(chuang)基因擴(kuo)(kuo)增(zeng)檢(jian)(jian)(jian)驗(yan)(yan)實驗(yan)(yan)室的(de)(de)建設(she)(she)越(yue)來(lai)越(yue)得(de)到重(zhong)視,因為它對(dui)檢(jian)(jian)(jian)測(ce)結果的(de)(de)可靠性(xing)(xing)、準確性(xing)(xing)和(he)安全性(xing)(xing)起到至關重(zhong)要(yao)的(de)(de)作(zuo)用(yong)。本(ben)文主(zhu)要(yao)從臨床(chuang)基因擴(kuo)(kuo)增(zeng)檢(jian)(jian)(jian)驗(yan)(yan)實驗(yan)(yan)室的(de)(de)平面(mian)布局,空調通風系統設(she)(she)計(ji)、氣流控制和(he)污染的(de)(de)防制幾(ji)個方(fang)面(mian)對(dui)實驗(yan)(yan)室設(she)(she)計(ji)中的(de)(de)主(zhu)要(yao)特點進行(xing)(xing)了闡述(shu)。
臨(lin)床基因(yin)擴增(zeng)檢驗實驗室(shi)設(she)計的(de)核心問(wen)題(ti)是如何避免污染。因(yin)此,實驗室(shi)的(de)平(ping)面布局、空調通風(feng) 系統設(she)計、氣流(liu)控制等都是圍繞這(zhe)個(ge)(ge)核心問(wen)題(ti)進(jin)行的(de)。下面就對這(zhe)幾個(ge)(ge)方(fang)面分(fen)別進(jin)說明。
二、 PCR實驗室平面(mian)布局
臨床基因擴增(zeng)檢(jian)驗實驗室原則上分(fen)(fen)為四個單獨的(de)工作區(qu)(qu)域:試劑(ji)貯存(cun)和(he)(he)準備(bei)(bei)區(qu)(qu)、標(biao)本制(zhi)備(bei)(bei)區(qu)(qu)、擴增(zeng)反(fan)應混合物配(pei)制(zhi)和(he)(he)擴增(zeng)區(qu)(qu)、擴增(zeng)產(chan)物分(fen)(fen)析區(qu)(qu)。為避免(mian)交叉污染,進入各(ge)個工作區(qu)(qu)域必須嚴格(ge)遵(zun)循單一方向(xiang)進行,即只能從試劑(ji)貯存(cun)和(he)(he)準備(bei)(bei)區(qu)(qu)→標(biao)本制(zhi)備(bei)(bei)區(qu)(qu)→擴增(zeng)反(fan)應混合物配(pei)制(zhi)和(he)(he)擴增(zeng)區(qu)(qu)→擴增(zeng)產(chan)物分(fen)(fen)析區(qu)(qu)。
各實驗(yan)區之間的試劑及(ji)樣品傳(chuan)遞(di)應(ying)通(tong)過傳(chuan)遞(di)窗進行。
三、實(shi)驗(yan)室空調通風系統設計及(ji)壓力控制
PCR實(shi)驗(yan)(yan)室并沒(mei)有嚴(yan)格的凈化要求,但(dan)是為避(bi)免(mian)各(ge)個實(shi)驗(yan)(yan)區(qu)域間(jian)交叉(cha)污染的可能(neng)性,宜采用全送全排(pai)的氣流組織形式。同時,要嚴(yan)格控制(zhi)送、排(pai)風的比例以(yi)保證各(ge)實(shi)驗(yan)(yan)區(qu)的壓力要求。
1、試劑貯存和準(zhun)備區
該實驗(yan)區(qu)主要進行的(de)操作(zuo)為(wei)貯存試劑(ji)的(de)制(zhi)(zhi)(zhi)備、試劑(ji)的(de)分裝和主反應混合(he)液的(de)制(zhi)(zhi)(zhi)備。試劑(ji)和用于標本(ben)制(zhi)(zhi)(zhi)作(zuo)的(de)材(cai)料(liao)應直(zhi)接運送至該區(qu),不得經(jing)過其(qi)他(ta)區(qu)域。試劑(ji)原材(cai)料(liao)必須貯存在本(ben)區(qu)內,并(bing)在本(ben)區(qu)內制(zhi)(zhi)(zhi)備成(cheng)所需的(de)貯存試劑(ji)。
對(dui)與(yu)氣流壓(ya)力的控制(zhi),本區并沒有(you)嚴格的要求。
2、標本制備區
該(gai)區域主要(yao)進行的(de)操作(zuo)為臨床標本的(de)保存、核酸(RNA、DNA)提取(qu)、貯存及其加入至(zhi)擴增反應管和測定RNA時cDNA的(de)合成。
本區的壓力梯度要求為(wei):相對于(yu)鄰(lin)近(jin)區域為(wei)正壓,以避免從鄰(lin)近(jin)區進入本區的氣溶(rong)(rong)膠(jiao)(jiao)污染。另(ling)外(wai),由于(yu)在(zai)加樣操作(zuo)中可能會發生氣溶(rong)(rong)膠(jiao)(jiao)所(suo)致的污染,所(suo)以應避免在(zai)本區內不(bu)必要的走動。
3、擴(kuo)增反(fan)應混合(he)物配制(zhi)和擴(kuo)增區
該(gai)區(qu)(qu)域(yu)主(zhu)要(yao)進行的(de)(de)操作為DNA或 cDNA擴增。此外,已制(zhi)備的(de)(de)DNA模板和(he)合成(cheng)的(de)(de) cDNA(來自樣(yang)本(ben)制(zhi)備區(qu)(qu)) 的(de)(de)加入和(he)主(zhu)反(fan)應(ying)混合液(ye)(來自試劑(ji)貯存和(he)制(zhi)備區(qu)(qu)) 制(zhi)備成(cheng)反(fan)應(ying)混合液(ye)等(deng)也(ye)可在(zai)本(ben)區(qu)(qu)內進行。在(zai)巢式(shi) PCR測(ce)定中,通常在(zai)一輪擴增后必(bi)須打開反(fan)應(ying)管,因此巢式(shi)擴增有較高的(de)(de)污染(ran)危險性,第二次(ci)加樣(yang)必(bi)須在(zai)本(ben)區(qu)(qu)內進行。
本(ben)區(qu)的(de)(de)壓力梯度要求為:相對(dui)于鄰近區(qu)域為負(fu)壓,以避免氣(qi)溶膠從本(ben)區(qu)漏出。為避免氣(qi)溶膠所(suo)致的(de)(de)污(wu)染,應盡量減少在本(ben)區(qu)內的(de)(de)不(bu)必(bi)要的(de)(de)走動。個(ge)別(bie)操作如加(jia)樣等應在超凈臺內進行。
4、擴增產物分析區
該區域主要進行的操作為擴增片段的測定(ding)。如使(shi)用全自動封(feng)閉分析儀器檢測,此區域可不設。
本區(qu)(qu)(qu)是最主要的(de)(de)擴(kuo)增產物污(wu)染來源,因此對本區(qu)(qu)(qu)的(de)(de)壓(ya)力(li)梯度的(de)(de)要求為(wei):相(xiang)對于(yu)鄰近(jin)區(qu)(qu)(qu)域(yu)為(wei)負壓(ya),以避免(mian)擴(kuo)增產物從本區(qu)(qu)(qu)擴(kuo)散至其它區(qu)(qu)(qu)域(yu)。
四(si)、污染的預防與控制
PCR實驗室設(she)計的核(he)心問題(ti)是如何避免(mian)污(wu)染。在實際工作中,常見的有以(yi)下幾種污(wu)染類型:擴增產物的污(wu)染;天(tian)然(ran)基因組DNA的(de)污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran);試劑的(de)污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran)以及標(biao)本間的(de)污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran)。由于一旦發(fa)生(sheng)污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran),實驗就必須(xu)停止,直到找到污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran)源為止,而且(qie)實驗結果必須(xu)作廢,需重新進行(xing)實驗。所以發(fa)生(sheng)污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran)后再圍繞實驗室(shi)來尋找污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran)源不但耗時而且(qie)繁(fan)瑣,浪(lang)費(fei)人(ren)力物力。因(yin)此要避(bi)免污(wu)(wu)(wu)(wu)染(ran),首先(xian)應是(shi)預防(fang),而不是(shi)排(pai)除。
1、工作區域的嚴(yan)格劃分(fen)
(1)各個(ge)實驗區域設(she)置(zhi)合理(li);
(2)各個(ge)(ge)實驗(yan)區域要有明顯(xian)的標記(如(ru)醒(xing)目的門牌(pai)或不同的地(di)面(mian)顏(yan)色等(deng)),以避免各個(ge)(ge)不同實驗(yan)區域設(she)備物品、試劑等(deng)發生混淆。
2、合理的系統設置
(1)合理的(de)(de)空(kong)調通風系(xi)統設置,盡(jin)量采用全送(song)全排(pai)的(de)(de)空(kong)調系(xi)統;
(2)嚴格的(de)氣流壓(ya)力(li)控(kong)制,保證不同的(de)實驗區內不同的(de)壓(ya)力(li)要求。
3、規范的操作
(1)臨床基因擴增(zeng)檢驗實驗室(shi)的(de)技術人員必須進(jin)行上崗培訓,經培訓合格后才能從事臨床基因擴增(zeng)檢驗的(de)工作(zuo);
(2)在實驗操作過程(cheng)中,操作者必須戴手(shou)套,并經常更換。此外(wai),操作中使用一(yi)次性帽子也是一(yi)個(ge)有效地防止污染的措施(shi);
(3)清潔工作(zuo)及時、正確。實驗(yan)工作(zuo)結束(shu)后,必須立即對本區進(jin)行(xing)清潔。除常(chang)規的(de)消(xiao)(xiao)(xiao)(xiao)毒(du)(du)液體對表(biao)面(mian)進(jin)行(xing)擦拭消(xiao)(xiao)(xiao)(xiao)毒(du)(du)或紫外線燈的(de)照射(she)消(xiao)(xiao)(xiao)(xiao)毒(du)(du)外,對一些實驗(yan)設備(bei)還應進(jin)行(xing)高壓消(xiao)(xiao)(xiao)(xiao)毒(du)(du)處理。
4、嚴格的管理
(1)嚴格(ge)控制進出實(shi)(shi)驗室的(de)人員(yuan)。與實(shi)(shi)驗無關的(de)人員(yuan)不得隨意進出實(shi)(shi)驗室,有條件的(de)情(qing)況下要設(she)置獨立(li)的(de)通(tong)道和(he)進出整個(ge)實(shi)(shi)驗區的(de)門;
(2)在(zai)各個實驗區(qu)域使(shi)用帶有明顯區(qu)別標志的工(gong)作服(如不(bu)同顏色),當工(gong)作人員離開(kai)時(shi)不(bu)得將本區(qu)的工(gong)作服帶至其(qi)它(ta)區(qu)域;
(3)盡量(liang)減少在實驗(yan)區內不必要的(de)走動以(yi)減少交叉(cha)污(wu)染(ran)的(de)可(ke)能性。
(4)擴增(zeng)(zeng)產(chan)(chan)物分析區是最(zui)主要的(de)擴增(zeng)(zeng)產(chan)(chan)物污染來源,廢液不能在(zai)實(shi)驗室(shi)中傾倒,必(bi)須經消毒(du)(du)液浸(jin)泡消毒(du)(du)后在(zai)遠離實(shi)驗室(shi)的(de)地方棄掉,用(yong)過的(de)吸頭等(deng)一(yi)次性(xing)材料也應經消毒(du)(du)液浸(jin)泡消毒(du)(du)后統(tong)一(yi)處理,如焚燒等(deng);
(5)擴增(zeng)產(chan)物分析區可能會用到(dao)某些可致(zhi)基因突變和(he)有毒物質,應(ying)特別注意(yi)實驗人員的安全防護。
5、完備的實驗室配套設施
完備的實驗室配套設(she)施是(shi)保(bao)證(zheng)實驗工作(zuo)的必要(yao)條件,應(ying)根據各(ge)個實驗室實驗內容的不同配備相(xiang)應(ying)的設(she)備和儀器,如超凈(jing)工作(zuo)臺(tai)、離心機、加樣(yang)器等。